[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: معرفي مجله :: آخرين شماره :: آرشيو مقالات :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
آرشیو مقالات::
در باره نشریه::
بانک‌ها و نمایه‌نامه‌ها::
هیئت تحریریه::
اعضای اجرایی::
ثبت نام::
راهنمای نگارش مقاله::
ارسال مقاله::
فرم تعهدنامه::
راهنما کار با وب سایت::
برای داوران::
پرسش‌های متداول::
فرایند ارزیابی و انتشار مقاله::
در باره کارآزمایی بالینی::
اخلاق در نشر::
در باره تخلفات پژوهشی::
لینکهای مفید::
تسهیلات پایگاه::
تماس با ما::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
Google Scholar

Citation Indices from GS

AllSince 2019
Citations67423102
h-index3118
i10-index21178
:: دوره 18، شماره 3 - ( پاییز 1395 ) ::
جلد 18 شماره 3 صفحات 117-111 برگشت به فهرست نسخه ها
ساختار ژنتیکی بورخولدریا مالئی رازی 325، سویه مورد استفاده در تولید صنعتی مالئین در ایران
الیکا فرج تبریزی1 ، کیوان تدین* 2، نادر مصوری3 ، الهه تاجبخش4 ، روح اله کشاورز5 ، رایناک قادری5 ، محمد سخاوتی6 ، رضا بنی هاشمی6 ، رضا نجف پور7 ، مریم مهره کش حقیقت8 ، مهدی دهقان پور9
1- کارشناس ارشد میکروب شناسی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران و کارشناس ارشد میکروب شناسی، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
2- دانشیار میکروب شناسی، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران. ، k.tadayon@rvsri.ac.ir
3- دانشیار میکروب شناسی، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران.
4- دانشیار، میکروب شناسی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران.
5- دامپزشک و کارشناس ارشد واکسن و سرم، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی ،کرج، ایران.
6- کارشناس ارشد واکسن و سرم، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران.
7- کارشناس ارشد میکروب شناسی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران.
8- کارشناس ارشد میکروب شناسی، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
9- کارشناس آزمایشگاه، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
چکیده:   (10494 مشاهده)

زمینه و هدف : ایران یکی از کانون‌های باقی‌مانده مهم مشمشه در خاورمیانه است و برای انجام آزمایش مالئیناسیون و شناسایی دام‌های مبتلا به مشمشه و یا آلوده از سویه غیربومی Burkholderia mallei Razi 325 برای تولید مالئین استفاده می‌گردد. روش ژنوتایپینگ Multi Locus Variable number tandem repeat Analysis (MLVA) به عنوان روش بین‌المللی تایپینگ بورخولدریا مالئی پذیرفته شده است. این مطالعه به منظور شناسایی ساختار ژنتیکی بورخولدریا مالئی رازی 325، سویه مورد استفاده در تولید صنعتی مالئین در ایران انجام شد.

روش بررسی : در این مطالعه توصیفی از روش MLVA genotyping با استفاده از 4 لوکوس شناخته شده VNTR140، VNTR1367، VNTR2065 و VNTR2971 و 2 لوکوس جدید VNTR24 و VNTR24 استفاده گردید.

یافته‌ها : نتیجه با بهینه‌سازی فرآیند PCR انجام آمپلیفیکاسیون هر 6 منطقه ژنتیکی به‌صورت همزمان توسط یک پروتکل مقدور گردید. محصولات آمپلیفیکاسیون تعیین توالی شدند. در ژنوم این سویه در لوکوس‌های VNTR140، VNTR1367، VNTR2065، VNTR2971، VNTR24 و VNTR24 به ترتیب 2، 3، 12، 6، 1 و 2 کپی از واحدهای تکرار شونده خاص هر لوکوس وجود داشت. این ساختار ژنتیکی با آنچه از سویه چینی Burkholderia mallei ATCC 23344 و سویه‌های Burkholderia mallei BMQ و Burkholderia mallei SAVP1 شناخته شده است؛ مقایسه گردید.

نتیجه‌گیری : نتایج حاصله امکان تشخیص افتراقی میان Razi 325 و سویه‌های فوق را به کمک این لوکوس‌ها نشان داد.

واژه‌های کلیدی: مشمشه، مالئین، بورخولدریا مالئی Razi 325، ژنوتایپینگ MLVA، VNTR
متن کامل [PDF 255 kb] [English Abstract]   (14700 دریافت) |   |   چکیده (HTML)  (1653 مشاهده)  
نوع مطالعه: تحقيقي | موضوع مقاله: میکروب شناسی
* نشانی نویسنده مسئول: کرج، حصارک، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، کدپستی 3197619751 ، تلفن 34502892-026 ، نمابر 34552194
فهرست منابع
1. Howe C, Sampath A, Spotnitz M. The pseudomallei group: a review. J Infect Dis. 1971 Dec; 124(6):598-606.
2. Dvorak GD, Spickler AR. Glanders. J Am Vet Med Assoc. 2008 Aug; 233(4):570-7. doi: 10.2460/javma.233.4.570
3. Malik P, Singha H, Khurana SK, Kumar R, Kumar S, Raut AA, et al. Emergence and re-emergence of glanders in India: a description of outbreaks from 2006 to 2011. Vet Ital. 2012 Apr-Jun; 48(2):167-78.
4. Hornstra H, Pearson T, Georgia S, Liguori A, Dale J, Price E, et al. Molecular epidemiology of glanders, Pakistan. Emerg Infect Dis. 2009 Dec; 15(12):2036-9. doi: 10.3201/eid1512.090738
5. Parker L, Creek B. Bioterrorism and Intelligence. Global Security Studies. 2013; 4(3): 53-63.
6. Khaki P, Mosavari N, Khajeh NS, Emam E, Ahouran M, Hashemi S, et al. Glanders outbreak at Tehran Zoo, Iran. Iran J Microbiol. 2012; 4(1): 3-7.
7. Mota RA, da Fonseca Oliveira AA, da Silva AM, Junior JW, da Silva LB, de Farias Brito M, Rabelo SS. Glanders in donkeys (Equus Asinus) in the state of pernambuco, Brazil: A case report. Braz J Microbiol. 2010 Jan; 41(1):146-9. doi: 10.1590/S1517-838220100001000021
8. Théodoridès J. [A great Franco-Mauritian epidemiologist: Joseph Désiré Tholozan (1820-18970]. Bull Soc Pathol Exot. 1998; 91(1):104-8. [Article in French]
9. Compant S, Nowak J, Coenye T, Clément C, Ait Barka E. Diversity and occurrence of Burkholderia spp. in the natural environment. FEMS Microbiol Rev. 2008 Jul; 32(4):607-26. doi: 10.1111/j.1574-6976.2008.00113.x
10. Vial L, Groleau MC, Dekimpe V, Déziel E. Burkholderia diversity and versatility: an inventory of the extracellular products. J Microbiol Biotechnol. 2007 Sep; 17(9):1407-29.
11. Sprague LD, Zysk G, Hagen RM, Meyer H, Ellis J, Anuntagool N, Gauthier Y, Neubauer H. A possible pitfall in the identification of Burkholderia mallei using molecular identification systems based on the sequence of the flagellin fliC gene. FEMS Immunol Med Microbiol. 2002 Nov; 34(3):231-6.
12. U'Ren JM, Schupp JM, Pearson T, Hornstra H, Clark Friedman CL, Smith KL, et al. Tandem repeat regions within the Burkholderia pseudomallei genome and their application for high resolution genotyping. BMC Microbiol. 2007; 7:23. doi: 10.1186/ 1471-2180-7-23
13. Michelle Wong Su Yen, Lisanti O, Thibault F, Toh Su San, Loh Gek Kee, Hilaire V, et al. Validation of ten new polymorphic tandem repeat loci and application to the MLVA typing of Burkholderia pseudomallei isolates collected in Singapore from 1988 to 2004. J Microbiol Methods. 2009 Jun; 77(3):297-301. doi: 10.1016/j.mimet.2009.03.005
14. Wernery U, Wernery R, Joseph M, Al-Salloom F, Johnson B, Kinne J, et al. Natural Burkholderia mallei infection in Dromedary, Bahrain. Emerg Infect Dis. 2011 Jul; 17(7): 1277-79. doi: 10.3201/eid1707.110222
15. Scholz HC, Pearson T, Hornstra H, Projahn M, Terzioglu R, Wernery R, et al. Genotyping of Burkholderia mallei from an outbreak of glanders in Bahrain suggests multiple introduction events. PLoS Negl Trop Dis. 2014 Sep; 8(9):e3195. doi: 10.1371/journal.pntd.0003195
16. Scholz HC, Joseph M, Tomaso H, Al Dahouk S, Witte A, Kinne J, et al. Detection of the reemerging agent Burkholderia mallei in a recent outbreak of glanders in the United Arab Emirates by a newly developed fliP-based polymerase chain reaction assay. Diagn Microbiol Infect Dis. 2006 Apr; 54(4):241-7.
17. Johnson SL, Bishop-Lilly KA, Ladner JT, Daligault HE, Davenport KW, Jaissle J, et al. Complete genome sequences for 59 Burkholderia isolates, both pathogenic and near neighbor. Genome Announc. 2015 Mar-Apr; 3(2): e00159-15. doi: 10.1128/genomeA. 00159-15
18. Winsor GL, Khaira B, Van Rossum T, Lo R, Whiteside MD, Brinkman FS. The Burkholderia Genome Database: facilitating flexible queries and comparative analyses. Bioinformatics. 2008 Dec; 24(23):2803-4. doi: 10.1093/bioinformatics/btn524
19. Najafi Olya Z, Tadayon K, Ghaderi R. [A simplified van erth single nucleotide polymorphism (SNP) typing method of bacillus anthracis applicable by traditional thermocycler machines]. Medical Laboratory Journal. 2015; 9(1): 97-103. [Article in Persian]
20. Untergasser A, Cutcutache I, Koressaar T, Ye J, Faircloth BC, Remm M, Rozen SG. Primer3--new capabilities and interfaces. Nucleic Acids Res. 2012 Aug; 40(15):e115.
21. Email author JY, Coulouris G, Zaretskaya I, Cutcutache I, Rozen S, Madden TL. Primer-BLAST: A tool to design target-specific primers for polymerase chain reaction. BMC Bioinformatics. 2012; 13:134. doi: 10.1186/1471-2105-13-134
22. Sekhavati M, Tadayon K, Ghaderi R, Banihashemi R, Jabbari AR, Shokri Gh, et al. “In-house” production of DNA size marker from a vaccinal Bacillus anthracis strain. Iran J Microbiol. 2015; 7(1): 45-49.
23. Li W, Cowley A, Uludag M, Gur T, McWilliam H, Squizzato S, et al. The EMBL-EBI bioinformatics web and programmatic tools framework. Nucl Acids Res. 2015; gkv279. doi: 10.1093/nar/ gkv279
24. Stucky BJ. SeqTrace: a graphical tool for rapidly processing DNA sequencing chromatograms. J Biomol Tech. 2012 Sep; 23(3):90-3. doi: 10.7171/jbt.12-2303-004
ارسال پیام به نویسنده مسئول


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Faraj Tabrizi E, Tadayon K, Mosavari N, Tajbakhsh E, Keshavarz R, Ghaderi R, et al . Genomic structure of Burkholderia mallei Razi 325, the strain used for industrial production of Mallein in Iran. J Gorgan Univ Med Sci 2016; 18 (3) :111-117
URL: http://goums.ac.ir/journal/article-1-2844-fa.html

الیکا فرج تبریزی ، کیوان تدین ، نادر مصوری ، الهه تاجبخش ، روح اله کشاورز ، رایناک قادری ، و همکاران. و همکاران.. ساختار ژنتیکی بورخولدریا مالئی رازی 325، سویه مورد استفاده در تولید صنعتی مالئین در ایران. مجله علمي دانشگاه علوم پزشكي گرگان. 1395; 18 (3) :111-117

URL: http://goums.ac.ir/journal/article-1-2844-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 18، شماره 3 - ( پاییز 1395 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله دانشگاه علوم پزشکی گرگان Journal of Gorgan University of Medical Sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 38 queries by YEKTAWEB 4657