fa ساختار ژنتیکی بورخولدریا مالئی رازی 325، سویه مورد استفاده در تولید صنعتی مالئین در ایران میکروب شناسی Microbiology تحقيقي Original Articles <p dir="RTL" style="font-style:normal;"><span style="font-size:11px;">زمینه و هدف : ایران یکی از کانون‌های باقی‌مانده مهم مشمشه در خاورمیانه است و برای انجام آزمایش مالئیناسیون و شناسایی دام‌های مبتلا به مشمشه و یا آلوده از سویه غیربومی <span dir="LTR">Burkholderia mallei Razi 325</span> برای تولید مالئین استفاده می‌گردد. روش ژنوتایپینگ <span dir="LTR">Multi Locus Variable number tandem repeat Analysis (MLVA)</span> به عنوان روش بین‌المللی تایپینگ بورخولدریا مالئی پذیرفته شده است. این مطالعه به منظور شناسایی ساختار ژنتیکی بورخولدریا مالئی رازی 325، سویه مورد استفاده در تولید صنعتی مالئین در ایران انجام شد.</span></p> <p dir="RTL" style="font-style:normal;"><span style="font-size:11px;">روش بررسی : در این مطالعه توصیفی از روش <span dir="LTR">MLVA genotyping</span> با استفاده از 4 لوکوس شناخته شده <span dir="LTR">VNTR140</span>، <span dir="LTR">VNTR1367</span>، <span dir="LTR">VNTR2065</span> و <span dir="LTR">VNTR2971</span> و 2 لوکوس جدید <span dir="LTR">VNTR24</span> و <span dir="LTR">VNTR24</span> استفاده گردید.</span></p> <p dir="RTL" style="font-style:normal;"><span style="font-size:11px;">یافته‌ها : نتیجه با بهینه‌سازی فرآیند <span dir="LTR">PCR</span> انجام آمپلیفیکاسیون هر 6 منطقه ژنتیکی به‌صورت همزمان توسط یک پروتکل مقدور گردید. محصولات آمپلیفیکاسیون تعیین توالی شدند. در ژنوم این سویه در لوکوس‌های <span dir="LTR">VNTR140</span>، <span dir="LTR">VNTR1367</span>، <span dir="LTR">VNTR2065</span>، <span dir="LTR">VNTR2971</span>، <span dir="LTR">VNTR24</span> و <span dir="LTR">VNTR24</span> به ترتیب 2، 3، 12، 6، 1 و 2 کپی از واحدهای تکرار شونده خاص هر لوکوس وجود داشت. این ساختار ژنتیکی با آنچه از سویه چینی <span dir="LTR">Burkholderia mallei ATCC 23344</span> و سویه‌های <span dir="LTR">Burkholderia mallei BMQ</span> و <span dir="LTR">Burkholderia mallei SAVP1</span> شناخته شده است؛ مقایسه گردید.</span></p> <p dir="RTL" style="font-style:normal;"><span style="font-size:11px;">نتیجه‌گیری : نتایج حاصله امکان تشخیص افتراقی میان <span dir="LTR">Razi 325</span> و سویه‌های فوق را به کمک این لوکوس‌ها نشان داد.</span></p> <p><strong>Background and Objective:</strong> Iran remains a major stronghold for glanders in the Middle East. In Iran, the non-indigenous <em>Burkholderia mallei </em>Razi 325 strain is used in manufacturing of the mallein, required for malleination of animals. Multi Locus Variable number tandem repeat analysis is currently the standard globally accepted genotyping system for Burkholderia mallei. This study was done to survey the genomic structure of <em>Burkholderia mallei</em> Razi 325, the strain used for industrial production of Mallein.</p> <p><strong>Methods: </strong>In this descriptive study, a MLVA genotyping system with 4 previously-characterized loci VNTR140, VNTR1367, VNTR2065, VNTR2971 along with two new loci of VNTR24, VNTR41 was used.</p> <p><strong>Results: </strong>Optimization of PCRs resulted in a single protocol that enabled simultaneous amplification of all the six loci. Sequencing of PCR products revealed there were 2, 3, 12, 6, 1 and 2 copies of the unit repeat hold in the genome of the <em>Burkholderia mallei </em>Razi 325 strain. This observation was extended to include the already-whole genome sequenced Chinese <em>Burkholderia mallei </em>ATCC 23344 and <em>Burkholderia mallei </em>BMQ and also <em>Burkholderia mallei </em>SAVP1 strains.</p> <p><strong>Conclusion: </strong>The <em>Burkholderia mallei </em>Razi 325 strain is distinguishable from the other three strains through MLVA genotyping method.</p> مشمشه , مالئین , بورخولدریا مالئی Razi 325 , ژنوتایپینگ MLVA , VNTR Glanders, Mallein, Burkholderia mallei Razi 325, MLVA genotyping, VNTR 111 117 http://goums.ac.ir/journal/browse.php?a_code=A-10-1-932&slc_lang=fa&sid=1 E Faraj Tabrizi الیکا فرج تبریزی 5900319475328460049662 5900319475328460049662 No M.Sc in Microbiology, Shahrekord Branch, Islamic Azad University, Shahrekord, Iran. M.Sc in Microbiology, Razi Vaccine and Serum Research Institute (RVSRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran کارشناس ارشد میکروب شناسی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران و کارشناس ارشد میکروب شناسی، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران K Tadayon کیوان تدین k.tadayon@rvsri.ac.ir 5900319475328460049663 5900319475328460049663 Yes Associate Professor, Department of Microbiology, Razi Vaccine and Serum Research Institute (RVSRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran. دانشیار میکروب شناسی، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران. N Mosavari نادر مصوری 5900319475328460049664 5900319475328460049664 No Associate Professor, Department of Microbiology, Razi Vaccine and Serum Research Institute (RVSRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran. دانشیار میکروب شناسی، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران. Tajbakhsh E الهه تاجبخش 5900319475328460049665 5900319475328460049665 No Associate Professor, Department of Microbiology, Shahrekord Branch, Islamic Azad University, Shahrekord, Iran. دانشیار، میکروب شناسی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران. Keshavarz R روح اله کشاورز 5900319475328460049666 5900319475328460049666 No Veterinarian, Razi Vaccine and Serum Research Institute (RVSRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran. دامپزشک و کارشناس ارشد واکسن و سرم، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی ،کرج، ایران. Ghaderi R رایناک قادری 5900319475328460049667 5900319475328460049667 No Veterinarian, Razi Vaccine and Serum Research Institute (RVSRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran. دامپزشک و کارشناس ارشد واکسن و سرم، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی ،کرج، ایران. Sekhavati M محمد سخاوتی 5900319475328460049668 5900319475328460049668 No M.Sc in Vaccine and Serum, Razi Vaccine and Serum Research Institute (RVSRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran. کارشناس ارشد واکسن و سرم، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران. Banihashemi R رضا بنی هاشمی 5900319475328460049669 5900319475328460049669 No M.Sc in Vaccine and Serum, Razi Vaccine and Serum Research Institute (RVSRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran. کارشناس ارشد واکسن و سرم، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران. Najafpour R رضا نجف پور 5900319475328460049670 5900319475328460049670 No M.Sc in Microbiology, Shahrekord Branch, Islamic Azad University, Shahrekord, Iran. کارشناس ارشد میکروب شناسی، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران. Mohrekesh Haghighat M مریم مهره کش حقیقت 5900319475328460049671 5900319475328460049671 No M.Sc in Microbiology, Razi Vaccine and Serum Research Institute (RVSRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran کارشناس ارشد میکروب شناسی، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران Dehghanpour M مهدی دهقان پور 5900319475328460049672 5900319475328460049672 No B.Sc in Laboratory Sciences, Razi Vaccine and Serum Research Institute (RVSRI), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran کارشناس آزمایشگاه، مؤسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران