[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: معرفي مجله :: آخرين شماره :: آرشيو مقالات :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 20، شماره 4 - ( زمستان 1397 ) ::
جلد 20 شماره 4 صفحات 115-122 برگشت به فهرست نسخه ها
شناسایی مولکولی سودوموناس استوتزری به روش duplex-PCR
رویا بیت سیاح (علوی شریف)1 ، فاطمه حدادی* 2، حسین کمال الدینی3 ، میرزا محمدرضا شریف مقدم4
1- کارشناس ارشد رشته ژنتیک، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه زابل، زابل، ایران
2- استادیار، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه زابل، زابل، ایران ، fatemeh.haddadi@uoz.ac.ir
3- استادیار، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه زابل، زابل، ایران
4- استادیار، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران
چکیده:   (902 مشاهده)

زمینه و هدف: روش duplex-PCR یک روش زیست شناسی با کاربرد گسترده است که قابلیت شناسایی اختصاصی و با حساسیت بالای میکروارگانیسم‌ها را داراست. این مطالعه به منظور شناسایی مولکولی سودوموناس استوتزری (Pseudomonas stutzeri) به روش duplex-PCR انجام شد.

روش بررسی: در این مطالعه توصیفی آزمایشگاهی باکتری Pseudomonas stutzeri ATCC 17588 از مرکز ذخایر ژنتیک تهیه و پس از کشت، DNA در فاز لگاریتمی رشد به روش جوشاندن استخراج گردید. سپس با استفاده از روش duplex-PCR مبادرت به شناسایی اختصاصی این باکتری گردید. پرایمرهای موردنظر با استفاده از ژن‌های catA و nirP طراحی شد. بررسی حساسیت و اختصاصیت واکنش duplex-PCR با استفاده از 5 باکتری انجام شد.

یافته‌ها: نتایج حاصل، تکثیر دو باند bp 512 و bp 249 را به ترتیب برای ژن catA و nirP نشان داد. نتایج بررسی اختصاصیت 100درصد تعیین شد و حساسیت 0.048 ng/mL از DNA ژنومی را برای هر دو ژن catA و nirP نشان داد.

نتیجه‌گیری: روش مولکولی duplex-PCR باتوجه به داشتن حساسیت و ویژگی مناسب و قابلیت شناسایی بالای باکتری سودوموناس استوتزری می‌تواند به عنوان یک روش روتین در آزمایشگاه‌های مجهز توسط افراد متخصص برای شناسایی موارد مشکوک مورد استفاده قرارگیرد.

واژه‌های کلیدی: سودوموناس استوتزری، duplex-PCR، ژن catA، ژن nirP
متن کامل [PDF 287 kb]   (180 دریافت)    
نوع مطالعه: تحقيقي | موضوع مقاله: میکروب شناسی
* نشانی نویسنده مسئول: نشانی: زابل، پردیس جدید دانشگاه زابل، دانشگاه ملی زابل، دانشکده علوم پایه، گروه زیست شناسی، تلفن 31232215-054، نمابر 31232180
فهرست منابع
1. Dixit U, Shanker R. Detection of water-borne pathogens: culture plate to genomics. Indian J of Sci Technol. 2009 Nov; 2(11): 59-71.
2. Pindi PK, Srinath RR, Shanker AS. Novel approaches of genomic DNA isolation for identification of Cultivable Bacteria. Jundishapur J Microbiol. 2013 Dec; 6(10): e8339. doi: 10.5812/jjm.8339
3. Moolenaar RL, Crutcher JM, San Joaquin VH, Sewell LV, Hutwagner LC, Carson LA, et al. A prolonged outbreak of Pseudomonas aeruginosa in a neonatal intensive care unit: did staff fingernails play a role in disease transmission? Infect Control Hosp Epidemiol. 2000 Feb; 21(2): 80-5. doi: 10.1086/501739
4. Aidar M, Line SR. A simple and cost-effective protocol for DNA isolation from buccal epithelial cells. Braz Dent J. 2007; 18(2): 148-52.
5. Osmani Bojd M, Kamaladini H, Haddadi F, Vaseghi A. Thiolated AuNP probes and multiplex PCR for molecular detection of Staphylococcus epidermidis. Mol Cell Probes. 2017 Aug; 34: 30-36. doi: 10.1016/j.mcp.2017.04.006
6. Aydemir O, Aydemir Y, Ozdemir M. The role of multiplex PCR test in identification of bacterial pathogens in lower respiratory tract infections. Pak J Med Sci. 2014 Sep; 30(5): 1011-16. doi: 10.12669/pjms.305.5098
7. Iroha IR, Oji AE, Nwosu OK, Amadi ES. Antimicrobial Activity of Savlon®, Izal® and Z-Germicide® Against Clinical Isolates of Pseudomonas aeruginosa from Hospital Wards. European Journal of Dentistry and Medicine. 2011; 3: 32-35. doi: 10.3923/ejdm.2011.32.35
8. White DG, McDermott PF. Biocides, drug resistance and microbial evolution. Curr Opin Microbiol. 2001 Jun; 4(3): 313-37.
9. Brooks G, Carroll KC, Butel J, Morse S. Medical Microbiology (Jawetz, Melnick, & Adelberg's Medical Microbiology). 24th ed. New York: McGraw-Hill Medical. 2007; pp: 352-46.
10. Eriksen HM, Iversen BG, Aavitsland P. Prevalence of nosocomial infections in hospitals in Norway, 2002 and 2003. J Hosp Infect. 2005 May; 60(1): 40-5. doi: 10.1016/j.jhin.2004.09.038
11. Gilardi GL, Mankin HJ. Infection due to Pseudomonas stutzeri. NY State J Med. 1973 Dec; 73(23): 2789-91.
12. Priestley GS, Holland J, Marsh B, Wilson R. Pseudomonas stutzeri septicaemia in association with a bullous skin eruption. Anaesth Intensive Care. 1996 Dec; 24(6): 710-13.
13. Reisler RB, Blumberg H. Community-acquired Pseudomonas stutzeri vertebral osteomyelitis in a previously healthy patient: case report and review. Clin Infect Dis. 1999 Sep; 29(3): 667-69.
14. Rosenberg I, Leibovici L, Mor F, Block C, Wysenbeek AJ. Pseudomonas stutzeri causing late prosthetic valve endocarditis. J R Soc Med. 1987 Jul; 80(7): 457-59. doi: 10.1177/014107688708000719
15. Lebowitz D, Gürses-Ozden R, Rothman RF, Liebmann JM, Tello C, Ritch R. Late-onset bleb-related panophthalmitis with orbital abscess caused by Pseudomonas stutzeri. Arch Ophthalmol. 2001 Nov; 119(11): 1723-25.
16. Lalucat J, Bennasar A, Bosch R, García-Valdés E, Palleroni NJ. Biology of Pseudomonas stutzeri. Microbiol Mol Biol Rev. 2006 Jun; 70(2): 510-47. doi: 10.1128/MMBR.00047-05
17. Hernandez Duquino H, Rosenberg FA. Antibiotic-resistant Pseudomonas in bottled drinking water. Can J Microbiol. 1987 Apr; 33(4): 286-89.
18. Holmes B. Identification and distribution of Pseudomonas stutzeri in clinical material. J Appl Bacteriol. 1986 May; 60(5): 401-11.
19. Taneja N, Meharwal SK, Sharma SK, Sharma M. Significance and characterisation of pseudomonads from urinary tract specimens. J Commun Dis. 2004 Mar; 36(1): 27-34.
20. Kim MJ, Kim HY. Species identification of commercial jerky products in food and feed using direct pentaplex PCR assay. Food Control. 2017; 78: 1-6. http://dx.doi.org/10.1016/j.foodcont.2017.02.027
21. Shahbazi B, Narenji H. [Comparison of four methods of DNA extraction from gram-negative and gram-positive bacteria]. Zanko J Med Sci. 2014; 15 (45) :9-16. [Article in Persian]
22. Solà M, Riudavets J, Agustí N. Detection and identification of five common internal grain insect pests by multiplex PCR. Food Cntrol. 2018 Feb; 84: 246-54. https://doi.org/10.1016/j.foodcont.2017.08.002
23. Markoulatos P, Siafakas N, Moncany M. Multiplex polymerase chain reaction: a practical approach. J Clin Lab Anal. 2002; 16(1): 47-51.
24. Cladera AM, Bennasar A, Barceló M, Lalucat J, García-Valdés E. Comparative genetic diversity of Pseudomonas stutzeri genomovars, clonal structure, and phylogeny of the species. J Bacteriol. 2004 Aug; 186(16): 5239-48. doi: 10.1128/JB.186.16.5239-5248.2004
ارسال پیام به نویسنده مسئول


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Beytsayyah (Alavi Sharif) R, Haddadi F, Kamaladini H, Sharifmoghadam M M R. Molecular detection of Pseudomonas stutzeri by duplex-PCR technique. J Gorgan Univ Med Sci. 2018; 20 (4) :115-122
URL: http://goums.ac.ir/journal/article-1-3543-fa.html

بیت سیاح (علوی شریف) رویا، حدادی فاطمه، کمال الدینی حسین، شریف مقدم میرزا محمدرضا. شناسایی مولکولی سودوموناس استوتزری به روش duplex-PCR. مجله علمي دانشگاه علوم پزشكي گرگان. 1397; 20 (4) :115-122

URL: http://goums.ac.ir/journal/article-1-3543-fa.html



دوره 20، شماره 4 - ( زمستان 1397 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی گرگان Journal of Gorgan University of Medical Sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.06 seconds with 31 queries by YEKTAWEB 3897