مجموعه کتب پزشکی کتابخانه بر اساس نظام رده بندی NLM و کتب غیر پزشکی بر اساس نظام رده بندی کنگره ( LC ) فهرست نویسی و سازماندهی گردیدهاند .مجموعه کتابخانه از سیستم قفسه باز برخوردار بوده و جهت ارائه خدمات الکترونیک به کاربران کتابخانه از برنامه آذرسا (نرمافزارکتابخانه) برخوردار می باشد که این نرم افزار به منظور تسهیل و تسریع در جستجوی منابع از طریق اینترنت و شبکه داخلیدانشگاه، منابع موجود در کتابخانه را در دسترس عموم کاربران قرار می دهد.