رسالت بیمارستان شهید مطهری گنبد ارائه خدمات بهداشتی-درمانی با کیفیت، عادلانه و مبتنی بر اخلاق پزشکی به تمامی مراجعان، با تکیه بر دانش روز و فناوری‌های نوین پزشکی، در جهت ارتقای سلامت جامعه و تحقق عدالت در دسترسی به خدمات درمانی می باشد.