Medical Laboratory Journal
Medical Laboratory Journal
mljgoums
Medical Sciences
http://mlj.goums.ac.ir
1
admin
2538-4449
10.52547/mlj
en
jalali
1393
4
1
gregorian
2014
7
1
8
2
online
1
fulltext
fa
تعیین گروه فیلوژنتیکی و فراوانی ژنهای blaCTX-M و blaCTX-M-15 در جدایههای اشریشیاکلی از عفونتهای گوارشی و مجاری ادراری در کودکان زیر 5 سال
Determination of Phylogenetic Group and Prevalence of blaCTX-M and blaCTX-M-15 Genes in Escherichia Coli Isolates from Intestinal and Urinary Tract Infections in under Five- Year- Old Children
تحقيقي
Original Paper
چکیده
زمینه و هدف: آنزیمهای بتالاکتاماز وسیع الطیف نوع CTX-M، گروهی از آنزیم ها هستند که به طور چشمگیری به ویژه در اشریشیاکلی در حال افزایش هستند. گزارش های محدودی در مورد زمینه فیلوژنتیکی جدایه های اشریشیاکلی از نمونه های بالینی کودکان زیر 5 سال در ایران وجود دارد. هدف از این مطالعه فیلوتایپینگ جدایه های اشریشیاکلی واجد ژن های blaCTX-15 و blaCTX-M از کودکان زیر 5 سال مبتلا به اسهال و عفونت مجاری ادراری بود.
روش بررسی: در مجموع 121 جدایه اشریشیاکلی (75 اسهالی و 46 عفونت مجاری ادراری) از کودکان زیر 5 سال جمع آوری گردید. جدایه ها براساس آزمایش باکتری شناسی استاندارد تشخیص داده شدند. استخراج DNA جدایه های اشریشیاکلی توسط روش هضم با سود صورت گرفت. آزمایش PCR به منظور فراوانی ژنهای blaCTX-15 و blaCTX-M در جدایه ها و همچنین به منظور تعیین گروه ها و تحت گروه های فیلوژنتیکی بوسیله شناسایی ژن-های yjaA و chuA و قطعه TspE4.C2 مورد استفاده قرار گرفت.
یافتهها: جدایهها متعلق به چهار گروه فیلوژنتیکی A (77/48 درصد)، B1 (04/14 درصد)، B2 (57/11 درصد) و D (62/25 درصد) بودند. در جدایههای اسهالی 37/13 درصد مثبت برای ژن blaCTX-M و 04/14 درصد برای دو ژن blaCTX-15 و blaCTX-M مثبت بودند. از 46 جدایه عفونت مجاری ادراری نیز 73/21 درصد برای ژن blaCTX-M و 21/15 درصد برای ژنهای blaCTX-15 و blaCTX-M مثبت بودند.
نتیجهگیری: فراوانی نسبتا بالایی از جدایههای اشریشیاکلی واجد ژن-های blaCTX-15 و blaCTX-M از کودکان زیر 5 سال در شهرستان خرم آباد مشاهده گردید. فیلوتایپینگ جدایههای واجد ژنهای blaCTX-15و blaCTX-M نشان میدهد که اغلب آنها در گروههای فیلوژنی A و D تعلق داشتند.
واژه های کلیدی: اشریشیاکلی، گروه فیلوژنتیک، بتالاکتاماز وسیع الطیف
Abstract
Background and Objective: CTX-M type extended spectrum beta-lactamases is a rapidly expanding group of enzymes encountered with increasing frequency, especially, in Escherichia coli (E. coli). There are a few reports on phylogenetic background of E. coli isolates from clinical sources of under five-year- old children in Iran. The purpose of this study was phylotyping of E. coli isolates having blaCTX-M and blaCTX-M-15 genes from under five-year- old children with diarrhea and urinary tract infection (UTI).
Material and Methods: A total of 121 E. coli isolates (75 diarrheas and 46 UTI) were obtained and identified as E. coli based on standard bacteriological tests. DNA was extracted from E. coli isolates by alkaline lysis method. PCR assay was used because of high frequency of blaCTX-M and blaCTX-M-15 genes in the isolates and also determination of phylogenetic group/subgroups by detection of yjaA and chuA genes and fragment TspE4.C2.
Results: The isolates belonged to four phylogenetic groups A (48.77%), B1 (14.04%), B2 (11.57%), and D (25.62%). In the diarrheic isolates,17.37% were positive for blaCTX-M and 14.04% of isolates possessed both blaCTX-M and blaCTX-15genes.Out of 46 UTI isolates, 21.73% were positive for blaCTX-M and 15.21% for blaCTX-M and blaCTX-M-15 genes.
Conclusion: A rather high prevalence of E. coli isolates with blaCTX-M and blaCTX-M-15 genes was observed in fewer than five-year- old children in Khoramabad city. Phylotyping of isolates possessing blaCTX-M and blaCTX-15genes showed that most of them belonge to A and D phylo-groups.
Keywords: Escherichia Coli, Phylogenetic Group, Extended-Spectrum Beta-Lactamase
اشریشیاکلی, گروه فیلوژنتیک, بتالاکتاماز وسیع الطیف
This paper should be cited as: Zhand S, Tabaraei A, Fotoohi F, Javid N, Bazoori M, Haji Mohammadi E, Ghaemi, A. [Detection of Seasonal Influenza H1N1 and H3N2 Viruses using RT-PCR Assay during 2009 Flu Pandemic in Golestan Province ]. MLJ. 2014, 8(2):27-3
33
40
http://mlj.goums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-222&slc_lang=fa&sid=1
F
Momeni
فردوس مومنی
10031947532846006228
10031947532846006228
No
MSc of Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, Shahid Bahonar University, Kerman, Iran
R
Ghanbarpour
رضا قنبرپور
10031947532846006229
10031947532846006229
No
Professor of Microbiology, Faculty of Veterinary Medicine, Shahid Bahonar University, Kerman, Iran
L
Dolatshah
لیلا دولتشاه
10031947532846006230
10031947532846006230
No
MSc of Bacteriology, Faculty of Veterinary Medicine, Shahid Bahonar University, Kerman, Iran
H
Alizade
حسام علیزاده
alizade.h2000@yahoo.com
10031947532846006231
10031947532846006231
Yes
PhD Student of Bacteriology, Research Center for Tropical and Infectious Diseases, Kerman University of Medical Sciences, Kerman, Iran