Medical Laboratory Journal
Medical Laboratory Journal
mljgoums
Medical Sciences
http://mlj.goums.ac.ir
1
admin
2538-4449
10.52547/mlj
en
jalali
1392
11
1
gregorian
2014
2
1
7
5
online
1
fulltext
fa
تعیین هویت اعضاء مایکوباکتریوم توبرکلوزیس کمپلکس با استفاده از روش های ملکولی
Identification of Mycobacterium Tuberculosis Complex, Using Molecular Methods
تحقيقي
Original Paper
چکیده
زمینه و هدف: تشابه بسیار میان ژنوم باکتری های مایکوباکتریوم توبرکولوزیس کمپلکس، تـشخیص افـــتراقی آنها با روش های بیوشــیمیایی مرسوم آزمایشگاهی را مشکل می نماید. این تحقیق به منظور شناسایی و تعیین هویت جدایه های مایکوباکتریوم توبرکولوزیس کمپلکس عامل بیماری در میان مسلولین استان گلستان صورت پذیرفته است.
روش بررسی: جدایه های جمع آوری شده از نمونه های کلینیکی 42 مسلول استان گلستان در محدوده زمانی 1387 تا 1389 به موسسه رازی منتقل و بر روی محیط های کشت لونشتاین- جانسون گلسیرینه و پیرووات دار، تجدید کشت گردیدند. ژنوم همه جدایه ها به روش جوشانیدن استخراج و هویت جدایه ها توسط یک برنامهPCR سه مرحله ای به نام روش Huard-Warren شامل آزمون های 16SrRNA Rv Typing مشتمل بر لوکوس های Rv0577, Rv3877.8, Rv1970, Rv3120, Rv1510 , IS1561) و RD typing (شامل لوکوس های (RD1, RD4, RD9, RD12) تعیین گردید.
یافته ها: هویت همه جدایه ها مایکوباکتریوم توبرکولوزیس تعیین شد و نشانه ای از آلودگی هیچ یک از بیماران به سایر اعضای مایکوباکتریوم توبرکلوزیس کمپلکس یا آلودگی هم زمان آنها به بیش از یک عضو کمپلکس مشاهده نگردید.
نتیجه گیری: با توجه به اهمیت پرورش گاو و گوسفند در اقتصاد منطقه فقدان مایکوباکتریوم بوویس در میان جدایه های بررسی شده تا حدودی غیر منتظره به نظر می رسد. همان گونه که این مطالعه نشان می دهد روش هوارد– وارن که انجام آن ساده و مقرون به صرفه می باشد، می تواند در هر دو گروه از آزمایشگاه های منطقه ای و همچنین مرجع در تشخیص افتراقی میان اعضاء مایکوباکتریوم توبرکلوزیس کمپلکس به کار گرفته شود.
واژه های کلیدی: مایکوباکتریوم توبر کلوزیس کمپلکس، روشHuard-Warren، 16SrRNA، استان گلستان، RD typing، Rv typing
Abstract
Background and Objective: A high level of homogeneity observed within all bacteria in the Mycobacterium tuberculosis complex makes a property that seriously challenges traditional biochemical-based identification methods of these pathogens in the laboratory. The work presented here was conducted to characterize Mycobacterium tuberculosis complex isolates in Golestan, Northern Iran.
Material and Methods: Between 2008 and 2010, 42 mycobacterial isolates were collected from clinical tuberculosis-suspected patients in Golestan province. The isolates were sub-cultured on fresh Mycobacterium-specific culture media including glycerinated and pyruvated Lowenstein-Jensen slopes. The isolates were subsequently subjected to a PCR-based identification scheme coined Huard-Warren method. This strategy consisted of three individual algorithms namely, 16SrRNA RV typing (Rv0577, Rv3877.8, Rv1970, Rv3120, Rv1510 and IS1561) and RD typing (RD1, RD 4, RD9 and RD12).
Results: All isolates were proved to be M. tuberculosis. Furthermore, none of the patients were being infected with any other member of the M. tuberculosis complex or simultaneously co-infected with two mycobacteria. This fundamental observation was independently obtained by specific culture media, RV typing and also RD typing.
Conclusion: Considering the fact that cattle and sheep farming play an important role in the economy of the region, absence of Mycobacterium bovis in the studied isolates can be unexpected to some extent. Huard-Warren which is a simple and cost-effective identification method can be used in both reference and regional laboratory for differential diagnosis of tuberculosis.
Keywords: Mycobacterium Tuberculosis Complex, Huard-WarrenMethod, 16SrRNA, Golestan Province, RD Typing, RV Typing
Mycobacterium Tuberculosis Complex, Huard-WarrenMethod, 16SrRNA, Golestan Province, RD Typing, RV Typing
9
15
http://mlj.goums.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-186&slc_lang=fa&sid=1
M
Eramabadi
مریم ارم آبادی
10031947532846005382
10031947532846005382
No
، دانشگاه ازاد اسلامی، تنکابن، ایران
K
Tadayon
کیوان تدین
k.tadayon@rvsri.ac.ir
10031947532846005383
10031947532846005383
Yes
، ﻣﻮﺳﺴﻪ ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت واﮐﺴﻦ و ﺳﺮم ﺳﺎزی رازی، ﮐﺮج، ایران
N
Mosavari
نادر مصوری
10031947532846005384
10031947532846005384
No
ﻣﻮﺳﺴﻪ ﺗﺤﻘﯿﻘﺎت واﮐﺴﻦ و ﺳﺮم ﺳﺎزی رازی، ﮐﺮج، ایران
R
Keshavarz
روح اله کشاورز
10031947532846005385
10031947532846005385
No
R
Banihashemi
رضا بنی هاشمی
10031947532846005386
10031947532846005386
No
R
Ghaderi
رایناک قادری
10031947532846005387
10031947532846005387
No
M
Sekhavati
محمد سخاوتی
10031947532846005388
10031947532846005388
No
M
Ahmadi
مهدی احمدی
10031947532846005389
10031947532846005389
No
P
Eramabadi
پریسا ارم ابادی
10031947532846005390
10031947532846005390
No
E
Khodaverdi Daryan
ابراهیم خداوردی داریان
10031947532846005391
10031947532846005391
No