[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: معرفي مجله :: آخرين شماره :: آرشيو مقالات :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
آرشیو مقالات::
در باره نشریه::
بانک‌ها و نمایه‌نامه‌ها::
هیئت تحریریه::
اعضای اجرایی::
ثبت نام::
راهنمای نگارش مقاله::
ارسال مقاله::
فرم تعهدنامه::
راهنما کار با وب سایت::
برای داوران::
پرسش‌های متداول::
فرایند ارزیابی و انتشار مقاله::
در باره کارآزمایی بالینی::
اخلاق در نشر::
در باره تخلفات پژوهشی::
لینکهای مفید::
تسهیلات پایگاه::
تماس با ما::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
Google Scholar

Citation Indices from GS

AllSince 2019
Citations71973398
h-index3219
i10-index22086
:: دوره 19، شماره 3 - ( پاییز 1396 ) ::
جلد 19 شماره 3 صفحات 110-105 برگشت به فهرست نسخه ها
تغییرات نوکلئوتیدی توالی ژن کدکننده پروتئین چند عملکردی X در فرد مبتلا به ویروس هپاتیت B
علیرضا محبی1 ، علی شاکری مقدم2 ، یوسف دوزندگان1 ، نازنین لرستانی1 ، اعظم میرعرب1 ، عبدالوهاب مرادی3 ، علیجان تبرایی* 4
1- دانشجوی کارشناسی ارشد ویروس شناسی پزشکی، کمیته تحقیقات دانشجویی دانشگاه، دانشگاه علوم پزشکی گلستان، گرگان، ایران
2- دانشجوی کارشناسی ارشد میکروب شناسی، کمیته تحقیقات دانشجویی دانشگاه، دانشگاه علوم پزشکی گلستان، گرگان، ایران
3- استاد، مرکز تحقیقات بیماری‌های عفونی، دانشگاه علوم پزشکی گلستان، گرگان، ایران
4- دانشیار، مرکز تحقیقات بیماری‌های عفونی، دانشگاه علوم پزشکی گلستان، گرگان، ایران ، tabarraei@goums.ac.ir
چکیده:   (10753 مشاهده)

زمینه و هدف : عفونت مزمن با ویروس هپاتیت B (HBV) یکی از عوامل اصلی در ایجاد سیروز و سرطان سلول کبدی است. بیماری‌زایی ویروس به‌وسیله پروتئین چندعملکردی x (HBx) صورت می‌گیرد. تغییر در توالی ژن کدکننده این پروتئین باعث تنظیم فاکتورهای نسخه‌برداری و بیماری‌زایی می‌شود. این مطالعه به منظور آنالیز ژنتیک تکاملی ژن کدکننده HBx در فرد مبتلا به HBV مزمن انجام شد.

روش بررسی : در این مطالعه توصیفی آزمایشگاهی ابتدا از فرد آلوده به عفونت مزمن با ویروس هپاتیت B توالی کامل کدکننده HBx تکثیر و کلون شد. سپس با توالی‌های مرجع ژنوتیپ‌ها، سروتیپ‌ها و زیرسروتیپ‌های مختلف ویروس موجود در پایگاه GenBank، همردیفی توسط نرم‌افزار CLC Sequence Viewer انجام شد. از نتیجه هم‌ردیفی برای رسم درخت فیلوژنیک توسط سرور T-rex و آنالیز ژنتیک جمعیت توسط نرم‌افزار DnaSP استفاده شد. انتخاب طبیعی در سطح نوکلئوتید و پروتئین توسط تست Tajima’s D انجام گردید.

یافته‌ها : جهش شناخته شده‌ای در سطح پروتئین در توالی کدکننده HBx فرد آلوده مزمن یافت نشد. نتایج انتخاب طبیعی نشان‌دهنده جهش‌های خنثی در ژن HBx بود. نتایج فیلوژنی نشان داد توالی کدکننده HBx در فرد آلوده مزمن قرابت ژنتیکی به ژنوتیپ D و زیرسروتیپ ayw2 داشت.

نتیجه‌گیری : چندریختی انتخاب طبیعی در ژن کدکننده HBx رخ می‌دهد. همچنین نتیجه فیلوژنی مطالعه حاضر با یافته‌های پیشین استان گلستان و ایران که فراوانی ژنوتیپ D و زیرسروتیپ ayw2 را گزارش داده‌اند؛ مطابقت دارد.

واژه‌های کلیدی: ویروس هپاتیت B پروتئین چندعملکردی x، ژنتیک جمعیت، DnaSP، ژنوتیپ D، سروتیپ ayw2
متن کامل [PDF 270 kb] [English Abstract]   (13651 دریافت) |   |   چکیده (HTML)  (1093 مشاهده)  
نوع مطالعه: تحقيقي | موضوع مقاله: ویروس شناسی
* نشانی نویسنده مسئول: گرگان، دانشگاه علوم پزشکی گلستان، دانشکده پزشکی، گروه میکروب شناسی، تلفن 32421717-017 ، نمابر 32325581
فهرست منابع
1. Zhang X, Zhang H, Ye L. Effects of hepatitis B virus X protein on the development of liver cancer. J Lab Clin Med. 2006 Feb; 147(2): 58-66. doi:10.1016/j.lab.2005.10.003
2. Hadziyannis SJ, Vassilopoulos D. Hepatitis B e antigen-negative chronic hepatitis B. Hepatology. 2001 Oct; 34(4 Pt 1): 617-24.
3. Zhang X, Dong N, Zhang H, You J, Wang H, Ye L. Effects of hepatitis B virus X protein on human telomerase reverse transcriptase expression and activity in hepatoma cells. J Lab Clin Med. 2005 Feb; 145(2): 98-104. doi:10.1016/j.lab.2004.11.018
4. Kidd-Ljunggren K, Oberg M, Kidd AH. Hepatitis B virus X gene 1751 to 1764 mutations: implications for HBeAg status and disease. J Gen Virol. 1997 Jun; 78 (Pt 6): 1469-78.
5. Yano Y, Azuma T, Hayashi Y. Variations and mutations in the hepatitis B virus genome and their associations with clinical characteristics. World J Hepatol. 2015; 7(3): 583-92. doi:10.4254/wjh.v7.i3.583
6. Przeworski M, Hudson RR, Di Rienzo A. Adjusting the focus on human variation. Trends Genet. 2000 Jul; 16(7): 296-302.
7. Rozas J. DNA sequence polymorphism analysis using DnaSP. Methods Mol Biol. 2009; 537: 337-50. doi:10.1007/978-1-59745-251-9_17
8. Kumar S, Stecher G, Tamura K. MEGA7: Molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol Biol Evol. 2016 Jul; 33(7): 1870-74. doi:10.1093/molbev/msw054
9. Librado P, Rozas J. DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data. Bioinformatics. 2009 Jun; 25(11): 1451-52. doi:10.1093/bioinformatics/btp187
10. Zhand S, Karami C, Hosseinzadeh Adli A, Tabarraei A, Khodabakhshi B, Moradi A. Correlation between hepatitis B G1896A precore mutations and HBeAg in chronic HBV patients. Jundishapur J Microbiol. 2015 Feb; 8(2): e17126. doi:10.5812/jjm.17126
11. Karami C, Adli AH, Zhand S, Tabarraei A, Talei R, Saeidi M, et al. Study of genotype, subtype and mutation in the S gene in hepatitis B patients Co-infected with HIV in Iran. Jundishapur J Microbiol. 2016; 9(12): 1-5.
12. Untergasser A, Cutcutache I, Koressaar T, Ye J, Faircloth BC, Remm M, et al. Primer3--new capabilities and interfaces. Nucleic Acids Res. 2012 Aug; 40(15): e115. doi:10.1093/nar/gks596
13. Ye J, Coulouris G, Zaretskaya I, Cutcutache I, Rozen S, Madden TL. Primer-BLAST: A tool to design target-specific primers for polymerase chain reaction. BMC Bioinformatics. 2012; 13: 134. doi:10.1186/1471-2105-13-134
14. Hall TA. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic acids symposium series. 1999; 41(2): 95-98.
15. Boc A, Diallo AB, Makarenkov V. T-REX: a web server for inferring, validating and visualizing phylogenetic trees and networks. Nucleic Acids Res. 2012 Jul; 40(Web Server issue): W573–W579. doi:10.1093/nar/gks485
16. Saitou N, Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Mol Biol Evol. 1987 Jul; 4(4): 406-25.
17. Rogers AR, Harpending H. Population growth makes waves in the distribution of pairwise genetic differences. Mol Biol Evol. 1992 May; 9(3): 552-69.
18. Tajima F. Statistical method for testing the neutral mutation hypothesis by DNA polymorphism. Genetics. 1989 Nov; 123(3): 585-95.
19. Moradi A, Zhand S, Ghaemi A, Javid N, Tabarraei A. Mutations in the S gene region of hepatitis B virus genotype D in Golestan Province-Iran. Virus Genes. 2012 Jun; 44(3): 382-87. doi:10.1007/s11262-012-0715-z
20. Mohebbi SR, Amini-Bavil-Olyaee S, Zali N, Noorinayer B, Derakhshan F, Chiani M, et al. Molecular epidemiology of hepatitis B virus in Iran. Clin Microbiol Infect. 2008 Sep; 14(9): 858-66. doi:10.1111/j.1469-0691.2008.02053.x
ارسال پیام به نویسنده مسئول


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Mohebbi A, Shakeri-Moghaddam A, Doudazndegan Y, Lorestani N, Mir-Arab A, Moradi A et al . Hepatitis B virus x protein coding sequence variation in chronically infected patient. J Gorgan Univ Med Sci 2017; 19 (3) :105-110
URL: http://goums.ac.ir/journal/article-1-3145-fa.html

علیرضا محبی ، علی شاکری مقدم ، یوسف دوزندگان ، نازنین لرستانی ، اعظم میرعرب ، عبدالوهاب مرادی و همکاران.. تغییرات نوکلئوتیدی توالی ژن کدکننده پروتئین چند عملکردی X در فرد مبتلا به ویروس هپاتیت B . مجله علمي دانشگاه علوم پزشكي گرگان. 1396; 19 (3) :105-110

URL: http://goums.ac.ir/journal/article-1-3145-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 19، شماره 3 - ( پاییز 1396 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله دانشگاه علوم پزشکی گرگان Journal of Gorgan University of Medical Sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 38 queries by YEKTAWEB 4660
Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons — Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)