[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: معرفي مجله :: آخرين شماره :: آرشيو مقالات :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
بخش‌های اصلی
صفحه اصلی::
آرشیو مقالات::
در باره نشریه::
بانک‌ها و نمایه‌نامه‌ها::
هیئت تحریریه::
اعضای اجرایی::
ثبت نام::
راهنمای نگارش مقاله::
ارسال مقاله::
فرم تعهدنامه::
راهنما کار با وب سایت::
برای داوران::
پرسش‌های متداول::
فرایند ارزیابی و انتشار مقاله::
در باره کارآزمایی بالینی::
اخلاق در نشر::
در باره تخلفات پژوهشی::
رضایت‌آگاهانه‌شرکت‌درمطالعه::
لینکهای مفید::
تسهیلات پایگاه::
تماس با ما::
::
جستجو در پایگاه

جستجوی پیشرفته
دریافت اطلاعات پایگاه
نشانی پست الکترونیک خود را برای دریافت اطلاعات و اخبار پایگاه، در کادر زیر وارد کنید.
Google Scholar

Citation Indices from GS

AllSince 2019
Citations66863001
h-index3117
i10-index20673
:: دوره 19، شماره 1 - ( بهار 1396 ) ::
جلد 19 شماره 1 صفحات 88-83 برگشت به فهرست نسخه ها
آنالیز بیوانفورماتیکی برای پیش‌بینی میکرو RNA های بالقوه مهارکننده فرایندهای رگزایی در سرطان
فاطمه طرقی 1، یعقوب طرقی2
1- کارشناس ارشد بیولوژی سلولی مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، واحد امور دارویی بستان آباد، بستان آباد، ایران ، fatoroghi@gmail.com
2- کارشناس ارشد انگل شناسی، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، آزمایشگاه هشترود، هشترود، ایران
چکیده:   (8979 مشاهده)

زمینه و هدف : با افزایش اندازه تومور، محیط سلول‏های توموری هیپوکسیک و اسیدیک شده و سلول‌ها شروع به افزایش تولید چندین نوع عامل رشد می‏کنند که در نتیجه آن تشکیل رگ‏های خونی موضعی آغاز می‏شود. به دنبال آن متاستاز سلول‌های سرطانی از طریق عروق خونی اتفاق می‌افتد، لذا مهار رگزایی می‌تواند روش جدیدی برای درمان سرطان باشد. این مطالعه به منظور آنالیز بیوانفورماتیکی برای پیش‌بینی میکرو RNA های بالقوه مهارکننده فرایندهای رگزایی در سرطان انجام گردید.

روش بررسی : در این مطالعه توصیفی میکرو RNA هایی با قابلیت اتصال به ژن‌های MMP دخیل در رگزایی تومور (MMP1-2-3-8-9-10-11-13) با استفاده از پایگاه داده mirwalk شناسایی گردید. انتخاب micro RNA های موثر براساس تعداد جایگاه اتصال آنها به 3'UTR ژن‌ها انجام شد. برای تعیین توالی مکمل ژن نمونه با micro RNA های منتخب از پایگاه داده Microrna استفاده گردید.

یافته‌ها : بیشترین تعداد جایگاه اتصال به ژن‌های دخیل در رگزایی تومور mir-1302 ، mir-516a ، mir-512 ، mir-511 ، mir-516b و mir-548 تعیین شد.

نتیجه‌گیری : micro RNA ها گزینه‌های مناسبی برای کشت سلولی و بررسی آزمایشگاهی به منظور یافتن راه‌های جدید پیشگیری از پیشرفت سرطان از طریق مهار رگزایی هستند.

واژه‌های کلیدی: بیوانفورماتیک، رگزایی، ماتریکس متالوپروتئیناز، micro RNA
متن کامل [PDF 253 kb] [English Abstract]   (12879 دریافت) |   |   چکیده (HTML)  (879 مشاهده)  
نوع مطالعه: تحقيقي | موضوع مقاله: ژنتیک
فهرست منابع
1. Semenza GL. Vasculogenesis, angiogenesis, and arteriogenesis: mechanisms of blood vessel formation and remodeling. J Cell Biochem. 2007 Nov; 102(4): 840-7. doi:10.1002/jcb.21523
2. Egginton S. Invited review: activity-induced angiogenesis. Pflugers Arch. 2009 Mar; 457(5): 963-77. doi:10.1007/s00424-008-0563-9
3. Kamat A, Rajoria S, George A, Suriano R, Shanmugam A, Megwalu U, et al. Estrogen-mediated angiogenesis in thyroid tumor microenvironment is mediated through VEGF signaling pathways. Arch Otolaryngol Head Neck Surg. 2011 Nov; 137(11): 1146-53. doi:10.1001/archoto.2011.194
4. Baharara J, Zafar-Balanezhad S, Nejad-Shahrokhabadi K, Hesami Z. The effects of different doses of atorvastatin on angiogenesis of chorioallantoic membrane of chick embryo Journal of Shahrekord University of Medical Sciences. 2012; 14(2): 82-9. [Article in persian]
5. Le Bitoux MA, Stamenkovic I. Tumor-host interactions: the role of inflammation. Histochem Cell Biol. 2008 Dec; 130(6): 1079-90. doi:10.1007/s00418-008-0527-3
6. Fam NP, Verma S, Kutryk M, Stewart DJ. Clinician guide to angiogenesis. Circulation. 2003 Nov; 108(21): 2613-8. doi:10.1161/01.CIR.0000102939.04279.75
7. Kermorvant-Duchemin E, Pinel AC, Lavalette S, Lenne D, Raoul W, Calippe B, et al. Neonatal hyperglycemia inhibits angiogenesis and induces inflammation and neuronal degeneration in the retina. PLoS One. 2013 Nov; 8(11): e79545. doi:10.1371/journal.pone.0079545
8. Kim KJ, Li B, Winer J, Armanini M, Gillett N, Phillips HS, et al. Inhibition of vascular endothelial growth factor-induced angiogenesis suppresses tumour growth in vivo. Nature. 1993 Apr; 362(6423): 841-4. doi:10.1038/362841a0
9. Kim KJ, Li B, Winer J, Armanini M, Gillett N, Phillips HS, et al. Inhibition of vascular endothelial growth factor-induced angiogenesis suppresses tumour growth in vivo. Nature. 1993 Apr; 362(6423): 841-4. doi:10.1038/362841a0
10. Pandya NM, Dhalla NS, Santani DD. Angiogenesis-a new target for future therapy. Vascul Pharmacol. 2006 May; 44(5): 265-74. doi:10.1016/j.vph.2006.01.005
11. Pasquet M, Golzio M, Mery E, Rafii A, Benabbou N, Mirshahi P, et al. Hospicells (ascites-derived stromal cells) promote tumorigenicity and angiogenesis. Int J Cancer. 2010 May; 126(9): 2090-101. doi:10.1002/ijc.24886
12. Fang S, Wei J, Pentinmikko N, Leinonen H, Salven P. Generation of functional blood vessels from a single c-kit+ adult vascular endothelial stem cell. PLoS Biol. 2012; 10(10): e1001407. doi:10.1371/journal.pbio.1001407
13. Tayebe R, Baharara J. [A review on angiogenesis in tumor] Journal of Cell & Tissue. Spring 2014; 5(1): 89-100. [Article in Persian]
14. Kanellopoulou C, Monticelli S. A role for microRNAs in the development of the immune system and in the pathogenesis of cancer. Semin Cancer Biol. 2008 Apr; 18(2): 79-88. doi:10.1016/j.semcancer.2008.01.002
15. Kim M, Kasinski AL, Slack FJ. MicroRNA therapeutics in preclinical cancer models. Lancet Oncol. 2011 Apr; 12(4): 319-21. doi:10.1016/S1470-2045(11)70067-5
16. Kim KJ, Li B, Winer J, Armanini M, Gillett N, Phillips HS, et al. Inhibition of vascular endothelial growth factor-induced angiogenesis suppresses tumour growth in vivo. Nature. 1993 Apr; 362(6423): 841-4. doi:10.1038/362841a0
17. Iyer RP, Patterson NL, Fields GB, Lindsey ML. The history of matrix metalloproteinases: milestones, myths, and misperceptions. Am J Physiol Heart Circ Physiol. 2012 Oct; 303(8): H919-30. doi:10.1152/ajpheart.00577.2012
18. Egeblad M1, Werb Z. New functions for the matrix metalloproteinases in cancer progression. Nat Rev Cancer. 2002 Mar; 2(3): 161-74. doi:10.1038/nrc745
19. Rundhaug JE. Matrix metalloproteinases and angiogenesis. J Cell Mol Med. 2005 Apr-Jun; 9(2): 267-85.
20. John A, Tuszynski G. The role of matrix metalloproteinases in tumor angiogenesis and tumor metastasis. Pathol Oncol Res. 2001; 7(1): 14-23.
21. Waugh DJ, Wilson C. The interleukin-8 pathway in cancer. Clin Cancer Res. 2008 Nov; 14(21): 6735-41. doi:10.1158/1078-0432.CCR-07-4843
22. Gabellini C, Trisciuoglio D, Desideri M, Candiloro A, Ragazzoni Y, Orlandi A, et al. Functional activity of CXCL8 receptors, CXCR1 and CXCR2, on human malignant melanoma progression. Eur J Cancer. 2009 Sep; 45(14): 2618-27. doi:10.1016/j.ejca.2009.07.007
23. Dweep H, Sticht C, Pandey P, Gretz N. miRWalk--database: prediction of possible miRNA binding sites by "walking" the genes of three genomes. J Biomed Inform. 2011 Oct; 44(5): 839-47. doi:10.1016/j.jbi.2011.05.002
24. Dweep H, Sticht C, Gretz N. In-Silico Algorithms for the Screening of Possible microRNA Binding Sites and Their Interactions. Current Genomics. 2013; 14(2): 127-36. doi:10.2174/1389202911314020005
25. Caldas C, Brenton JD. Sizing up miRNAs as cancer genes. Nat Med. 2005 Jul; 11(7): 712-4.
26. Meng F, Henson R, Lang M, Wehbe H, Maheshwari S, Mendell JT, et al. Involvement of human micro-RNA in growth and response to chemotherapy in human cholangiocarcinoma cell lines. Gastroenterology. 2006 Jun; 130(7): 2113-29.
ارسال پیام به نویسنده مسئول


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Toroghi F, Toroghi Y. Bioinformatics analysis to predict potential Micro-RNAs inhibiting processes of angiogenesis in cancer. J Gorgan Univ Med Sci 2017; 19 (1) :83-88
URL: http://goums.ac.ir/journal/article-1-3021-fa.html

طرقی فاطمه، طرقی یعقوب. آنالیز بیوانفورماتیکی برای پیش‌بینی میکرو RNA های بالقوه مهارکننده فرایندهای رگزایی در سرطان . مجله علمي دانشگاه علوم پزشكي گرگان. 1396; 19 (1) :83-88

URL: http://goums.ac.ir/journal/article-1-3021-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 19، شماره 1 - ( بهار 1396 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله دانشگاه علوم پزشکی گرگان Journal of Gorgan University of Medical Sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.05 seconds with 38 queries by YEKTAWEB 4645