در این کارگروه ، چهار کارگروه فرعی تخصصی ذیل وجود دارند :

  - کارگروه فرعی تخصصی آمادگی

  - کارگروه فرعی تخصصی کاهش آسیب پذیری

  - کارگروه فرعی تخصصی آموزش، اطلاعات و پژوهش

  - کارگروه فرعی تخصصی پشتیبانی

  دبیر کارگروه تخصصی عملیاتی استان سرپرست مرکز مدیریت حوادث وفوریتهای پزشکی و در شهرستان رئیس مرکز بهداشت شهرستان خواهد بود که توسط رئیس کارگروه استان و شهرستان ابلاغ می گردد.

  مهمترین وظایف کارگروههای فرعی عبارتند از:

  - تهیه و بررسی ارزیابی و تصویب برنامه ها ، لوایح ، طرحها ، موافقت نامه ها ، استانداردها و راهنماها در حوزه فعالیت هر کارگروه فرعی تخصصی یا جهت پیشنهاد به سایر کارگروههای فرعی تخصصی

  - اجرایی نمودن پیشنهادات ، برنامه ، لوایح ، طرحها ، قوانین و موافقت نامه های مصوب در کارگروه فرعی و ارائه آنها به دبیرخانه کارگروه

  - ساماندهی و فعالیتهای مرتبط با مدیریت بحران درحوزه فعالیت هرکارگروه فرعی تخصصی

  - نظارت و هدایت کارگروه استان و شهرستان در حوزه فعالیت هرکارگروه فرعی و تخصصی از طریق دبیرخانه کارگروه کارشناس ذیربط

  - تهیه گزارش و پسخوراند جهت سطوح بالاتر و پائین تر